Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Tmod1P49813 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Tmod1P49813 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Tmod1P49813 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Tmod1P49813 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Tmod1P49813 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Tmod1P49813 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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