Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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