Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tnfsf4P43488 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf4P43488 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf4P43488 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf4P43488 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf4P43488 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf4P43488 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf4P43488 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf4P43488 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf4P43488 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf4P43488 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tnfsf4P43488 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms