Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Mterf1a-201ENSMUST00000044746 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms