Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms