Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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BckdkO55028 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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BckdkO55028 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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BckdkO55028 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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BckdkO55028 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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BckdkO55028 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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BckdkO55028 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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BckdkO55028 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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BckdkO55028 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
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BckdkO55028 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 666.8 ms