Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TsksO54887 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TsksO54887 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TsksO54887 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TsksO54887 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TsksO54887 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TsksO54887 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TsksO54887 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TsksO54887 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TsksO54887 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TsksO54887 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TsksO54887 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TsksO54887 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TsksO54887 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TsksO54887 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TsksO54887 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TsksO54887 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TsksO54887 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TsksO54887 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TsksO54887 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TsksO54887 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TsksO54887 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TsksO54887 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TsksO54887 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TsksO54887 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TsksO54887 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TsksO54887 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TsksO54887 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TsksO54887 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TsksO54887 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TsksO54887 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TsksO54887 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TsksO54887 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TsksO54887 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TsksO54887 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TsksO54887 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TsksO54887 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TsksO54887 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TsksO54887 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TsksO54887 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms