Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms