Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm20939L7N243 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20939L7N243 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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