Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 AC114645.2-201ENSMUST00000214308 791 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Olfr53-201ENSMUST00000084456 1328 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm13056-201ENSMUST00000142429 564 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm28053-203ENSMUST00000204408 351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms