Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21977F6U3N7 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms