Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms