Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms