Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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