Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Usf3B2RUQ2 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Usf3B2RUQ2 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Usf3B2RUQ2 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Usf3B2RUQ2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Usf3B2RUQ2 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Usf3B2RUQ2 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms