Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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