Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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PtprfA2A8L5 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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PtprfA2A8L5 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms