Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms