Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Krt27Q9Z320 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Krt27Q9Z320 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt27Q9Z320 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Krt27Q9Z320 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Krt27Q9Z320 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Krt27Q9Z320 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Krt27Q9Z320 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms