Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms