Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Crlf3Q9Z2L7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Crlf3Q9Z2L7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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