Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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