Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Lgr5Q9Z1P4 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Lgr5Q9Z1P4 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lgr5Q9Z1P4 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lgr5Q9Z1P4 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lgr5Q9Z1P4 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lgr5Q9Z1P4 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lgr5Q9Z1P4 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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