Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms