Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms