Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms