Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms