Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim26Q99PN3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim26Q99PN3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim26Q99PN3 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim26Q99PN3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim26Q99PN3 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim26Q99PN3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim26Q99PN3 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim26Q99PN3 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim26Q99PN3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim26Q99PN3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim26Q99PN3 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim26Q99PN3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
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Trim26Q99PN3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trim26Q99PN3 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trim26Q99PN3 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Trim26Q99PN3 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Trim26Q99PN3 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim26Q99PN3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms