Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Hdac9Q99N13 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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