Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms