Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms