Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rnf144aQ925F3 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rnf144aQ925F3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rnf144aQ925F3 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rnf144aQ925F3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rnf144aQ925F3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rnf144aQ925F3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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