Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PpcsQ8VDG5 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms