Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms