Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrrdQ8K2M3 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms