Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbm28Q8CGC6 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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