Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ttc21aQ8C0S4 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ttc21aQ8C0S4 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ttc21aQ8C0S4 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms