Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtpaQ8BWP5 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms