Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc30Q8BVF4 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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