Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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