Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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