Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smchd1Q6P5D8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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