Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 E030025P04Rik-201ENSMUST00000106710 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm37218-201ENSMUST00000192917 390 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC8.78□□□□□ -1
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NipblQ6KCD5 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm15221-201ENSMUST00000144439 414 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.78□□□□□ -1
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NipblQ6KCD5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
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NipblQ6KCD5 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
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NipblQ6KCD5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
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