Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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