Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms