Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Obox3Q3UT54 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Obox3Q3UT54 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Obox3Q3UT54 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Obox3Q3UT54 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox3Q3UT54 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox3Q3UT54 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox3Q3UT54 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Obox3Q3UT54 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Obox3Q3UT54 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Obox3Q3UT54 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Obox3Q3UT54 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Obox3Q3UT54 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Obox3Q3UT54 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Obox3Q3UT54 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Obox3Q3UT54 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Obox3Q3UT54 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Obox3Q3UT54 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Obox3Q3UT54 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Obox3Q3UT54 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Obox3Q3UT54 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Obox3Q3UT54 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Obox3Q3UT54 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Obox3Q3UT54 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms