Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rmi2Q3UPE3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rmi2Q3UPE3 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rmi2Q3UPE3 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rmi2Q3UPE3 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms