Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CrxosQ3UL53 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxosQ3UL53 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.9 ms