Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nom1Q3UFM5 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms