Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms